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Selon le bulletin de surveillance épidémiologique de Santé publique France publié le 19 octobre 2026, l’épidémie de gastro-entérite liée au rotavirus A se poursuit, tandis que les virus grippaux circulent activement. Malgré une baisse des indicateurs digestifs, la vigilance reste de mise, notamment pour les nourrissons, les jeunes enfants et les personnes âgées.
Après trois semaines consécutives de hausse, le taux de positivité du rotavirus A est passé de 32,6 % en semaine 40 à 24,8 % en semaine 41, du 5 au 11 octobre. Le nombre de prélèvements positifs a légèrement diminué, passant de 30 à 28. L’épidémie, amorcée en semaine 36, reste toutefois en cours.
D’autres bactéries responsables d’infections digestives circulent également. Les analyses ont détecté Escherichia coli entéroagrégatif dans 43 prélèvements, soit un taux de positivité de 38,1 %, et Escherichia coli entéropathogène dans 36 prélèvements, soit 31,9 %. Ces bactéries peuvent notamment se transmettre par des aliments contaminés.
Un nourrisson admis en réanimation
Au Centre hospitalier de Mayotte (CHM), 26 passages aux urgences pour gastro-entérite aiguë ont été enregistrés en semaine 41, contre 33 la semaine précédente, soit une baisse de 21 %. Les hospitalisations sont également passées de 13 à 9. Un nourrisson de huit mois a néanmoins dû être admis en réanimation.
Pour limiter les contaminations, les autorités sanitaires recommandent le lavage régulier des mains, le nettoyage des surfaces et une hydratation suffisante en cas de diarrhée ou de vomissements. Les signes de déshydratation chez les jeunes enfants nécessitent une attention particulière.
La grippe A(H1N1) progresse
Les virus grippaux constituent l’autre point de vigilance. Leur circulation a été détectée précocement, dès la semaine 30, alors que les épidémies surviennent habituellement entre décembre et mars.
En semaine 41, les virus grippaux sont devenus majoritaires parmi les virus respiratoires détectés au laboratoire du CHM, devant les rhinovirus. Le sous-type A(H1N1) prédomine, avec 17 prélèvements positifs et un taux de positivité de 26,9 %.
Toutefois, l’interprétation de ces données reste limitée par une interruption des analyses pendant deux semaines, en raison d’une rupture de réactifs. À la reprise, seuls 63 prélèvements ont été analysés, contre 123 en semaine 38. Santé publique France maintient donc le territoire en phase pré-épidémique, faute de données suffisantes pour confirmer une intensification durable de la circulation grippale.
Les gestes de prévention recommandés
Les infections respiratoires continuent de peser sur les structures de soins. La part des consultations pour pathologies respiratoires dépasse 10 % depuis la semaine 36 dans les centres médicaux de référence et les dispensaires. Deux enfants de moins d’un an ont également été admis en réanimation pour une bronchiolite non associée au virus respiratoire syncytial (VRS).
Le port du masque dès l’apparition de symptômes, le lavage des mains et l’aération des espaces clos sont recommandés. La vaccination contre la grippe est particulièrement conseillée aux personnes âgées, aux femmes enceintes et aux personnes souffrant de certaines maladies chroniques.
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